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YujieLu10/Graph_Project

 
 

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4.13.2019 zhiling zhou

Network_Construction

Step1_main.m

根据佳楠学姐整理的数据(lung data_latest version)构造无向有权的graph。生成imageWithROIs,SUVpara和graphWithROIs三个文件。最后一个是每个病人肿瘤的邻接矩阵,用于在step2里面提取特征。

Step2_Computer_Features

根据邻接矩阵提取特征。需要下载这个函数包。很多特征是基于这个文档提取的。计算速度根据肿瘤的大小差异会很大(注释掉的那些特征要算很久,12h+)。

ANN_Classifier

里面提供了一个两层的神经网络的分类器,分成二分类和多分类两种。输入是之前提取出的特征,输出是分类结果。

XGBoost主要用于研究不同的特征对于分类结果的贡献大小,参数还没调得很好,如果要用的话需要继续调教。

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