add categories and sftp blog

source/_posts/2024-09-08.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 20240908
 date: 2024-09-08 14:51:56
 tags: diary
+categories: diary
 ---
 
 今天是新学期第一个周日，预定是完成课后作业，和多组学项目那边的负责人对一下代码，有多余时间就看一下 tangram 论文。

source/_posts/2024-09-12.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 20240912
 date: 2024-09-12 17:47:39
 tags: diary
+categories: diary
 ---
 
 # 22 端口

source/_posts/2024-09-14.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 20240914
 date: 2024-09-14 14:08:24
 tags: diary
+categories: diary
 ---
 
 上午刚开完会被拷打，还算是这个星期跑出来的结果不错，给我顺利过关了。明天要开会迎接新研一，顺便去吃饭！导还说再分配一个研一跟我一起做生信的项目，不过今年下半年就要出成果的话，刚学了点深度学习基础的研一恐怕也派不上大用场。

source/_posts/R语言使用命令行参数.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: R语言使用命令行参数
 date: 2024-09-18 08:46:29
 tags: R
+categories: coding
 ---
 
 因为用同一个文件对不同数据集画图的时候，每次都改文件内容有点麻烦，而且容易忘，所以有使用命令行参数的需求。
@@ -38,20 +39,36 @@ print(args[4])
 args <- commandArgs()
 ```
 
-运行一个输出参数 0~9 的测试文件：
+实践是检验真理的唯一标准。我们先写一个输出参数 0~9 的测试文件`test.R`：
+
+```R test.R
+Args <- commandArgs()
+cat("Args[0] =", Args[0], "\n")
+cat("Args[1] =", Args[1], "\n")
+cat("Args[2] =", Args[2], "\n")
+cat("Args[3] =", Args[3], "\n")
+cat("Args[4] =", Args[4], "\n")
+cat("Args[5] =", Args[5], "\n")
+cat("Args[6] =", Args[6], "\n")
+cat("Args[7] =", Args[7], "\n")
+cat("Args[8] =", Args[8], "\n")
+cat("Args[9] =", Args[9], "\n")
+```
+
+终端运行`test.R`进行测试：
 
 ```bash
 > Rscript.exe .\beifen\R_plot\test.R a b c d
-Args[0]=
-Args[1]= D:\R-4.4.1\bin\x64\Rterm.exe
-Args[2]= --no-echo
-Args[3]= --no-restore
-Args[4]= --file=.\beifen\R_plot\test.R
-Args[5]= --args
-Args[6]= a
-Args[7]= b
-Args[8]= c
-Args[9]= d
+Args[0] =
+Args[1] = D:\R-4.4.1\bin\x64\Rterm.exe
+Args[2] = --no-echo
+Args[3] = --no-restore
+Args[4] = --file=.\beifen\R_plot\test.R
+Args[5] = --args
+Args[6] = a
+Args[7] = b
+Args[8] = c
+Args[9] = d
 ```
 
-可以看出用户输入参数是从第六个开始的。
+可见用户输入参数是从第六个开始的。

source/_posts/github推送报错解决.md

@@ -6,6 +6,7 @@ tags:
   - github
   - ssh
   - Tokens
+categories: environment
 ---
 
 # 报错

source/_posts/ssh和sftp配置.md

@@ -0,0 +1,84 @@
+---
+title: ssh和sftp配置
+date: 2024-09-19 21:10:46
+tags:
+  - ssh
+  - sftp
+categories: environment
+---
+
+# SSH
+
+关于怎么配置 github 的 ssh 密钥，我在{% post_link github推送报错解决 %}中已经记录过，故不赘述。
+
+这次主要是解决一个小问题，用校园网无法通过 ssh 连接 github。我再{% post_link 20240912 %}中提到校园网 ban 了 22 端口，但今天发现不是这样。参考[这篇博客](https://www.alonetech.com/2024/01/19/2586.html)，修改`~/.ssh`（在 windows 环境为`C:\Users\Username\.ssh`）目录下的`config`文件，如果没有就新建。
+
+```config ~/.ssh/config
+Host github.com
+  HostName ssh.github.com
+```
+
+也就是把`github.com`作为`ssh.github.com`的别名。设置之后就可以正常连接 ssh 了。
+
+# SFTP
+
+## 设置别名
+
+sftp 是用来在服务器和本机之间传输文件的，只要能连上服务器，sftp 几乎不需要配置。参考[师兄的 notion](https://rylynn.notion.site/SFTP-f6d6bb9bdbeb45fab80fe1d8a53bef07)。
+
+首先可以在本地的`~/.ssh/config`文件中设置服务器 ip 的别名，如：
+
+```config ~/.ssh/config
+Host adana
+  HostName 127.0.0.1
+  User yamada
+  Port 22
+```
+
+设置完之后，`yamada@adana`就相当于`[email protected]`的效果。服务器密码该输还得输，没有任何变化，这一步仅仅只是为了简化每次要输入 ip 地址的一长串。
+
+## 连接
+
+然后使用 sftp 代替 ssh 命令来连接。
+
+```bash
+# 不指定端口（使用22端口）
+sftp yamada@adana
+# 指定端口（也可以事先在~/.ssh/config设置好Port
+sftp -oPort=custom_port yamada@adana
+# 连接成功后会进入
+sftp>
+```
+
+## 基本命令
+
+连接上之后，可以互传文件。使用`help`或 `?` 来访问 sftp 的命令帮助。
+
+需要注意的是：
+
+1. 服务器相关命令没有变化，但无法使用 `~` 来访问`/home/username`路径。
+2. 本地的命令需要在前面加 `l`，如`cd`->`lcd`, `pwd`->`lpwd`, `ls`->`lls`。
+
+## 下载
+
+从服务器下载到本地，使用`get`命令。
+
+```bash
+# 直接下载
+sftp> get remoteFile
+Fetching /home/demouser/remoteFile to remoteFile
+/home/demouser/remoteFile                       100%   37KB  36.8KB/s   00:01
+# 指定下载文件名字（和服务器上的名字不同）
+sftp> get remoteFile localFile
+# 递归地下载目录
+sftp> get -r someDirectory
+```
+
+## 上传
+
+使用`put`命令，方法和`get`相同。
+
+```bash
+sftp> put localFile
+sftp> put -r localDirectory
+```

source/_posts/从协方差到典型相关分析-CCA.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-12 21:10:05
 tags:
   - math
   - linear algebra
+categories: math
 ---
 
 <meta name="referrer" content="no-referrer" />

source/_posts/余弦相似性.md

@@ -3,6 +3,7 @@ title: 余弦相似性
 date: 2024-09-12 08:23:30
 tags:
   - math
+categories: math
 ---
 
 虽然项目中一直在用这两种方法，但其实关于原理我是一窍不通~~（cv 大法好）~~，今天来学习一下。

source/_posts/关于搭建博客的博客.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 关于搭建博客的博客
 date: 2024-09-07 19:29:57
 tags: blog
+categories: environment
 ---
 
 # 前言

source/_posts/内积和外积.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-11 14:20:38
 tags:
   - linear algebra
   - math
+categories: math
 ---
 
 # 前言

source/_posts/损失函数可以是负数吗.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-10 14:19:56
 tags:
   - deep learning
   - loss function
+categories: DL
 ---
 
 今天尝试改代码的时候不得不面对这样一个问题：代码中计算的损失函数，是相关性（正数，越大越优）直接取负的结果。

source/_posts/教員情報集め.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 教員情報集め
 date: 2024-09-14 18:30:16
 tags: info
+categories: others
 ---
 
 各大学の教員情報を集めてメモします。

source/_posts/空间转录组和单细胞转录组.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 空间转录组和单细胞转录组
 date: 2024-09-16 09:29:44
 tags: biology
+categories: biology
 ---
 
 <meta name="referrer" content="no-referrer" />

source/_posts/蒙特卡罗方法.md

@@ -2,6 +2,7 @@
 title: 蒙特卡罗方法
 date: 2024-09-11 21:16:37
 tags: math
+categories: math
 ---
 
 # 介绍

source/_posts/记录两个代码错误.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-10 21:06:29
 tags:
   - debug
   - normalization
+categories: coding
 ---
 
 # 错误 1

source/_posts/证明可导必定连续.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-11 20:36:57
 tags:
   - math
   - calculus
+categories: math
 ---
 
 非常简单的一行小证明，但刚刚就是死活证不出来。看了 MIT 视频豁然开朗。

source/_posts/重新部署博客并解决gitee图床链接无法显示的问题.md

@@ -4,6 +4,7 @@ date: 2024-09-15 11:16:02
 tags:
   - debug
   - blog
+categories: environment
 ---
 
 <meta name="referrer" content="no-referrer" />