本任务，即数据管理中心和仪器集成控制软件系统，在高通量筛选的整个仪器设备开发中的作用相当于中枢神经系统。 任务的核心功能包括：
- 连接 高通量筛选仪是一个超大型仪器，实际上是由众多的子系统（仪器）集成而来。这些仪器部件之间、仪器之间、仪器与控制中心之间如何通讯连接才能无缝成为一个整体是最基本的问题。“连接”是一种智能集成，包含多层次的标准体系和接口技术。
- 监控 中央控制软件对各仪器的监控、协调，实现高通量筛选流程。
- 采集和分析 采集过程数据、存储，建立数据中心，实现专家系统，对数据进行在线和离线的分析。
- 交互 整个系统的设置、操作以及结果反馈都是通过软件实现。一个良好的软件人机界面是仪器设备可用性的重要因素。
因此本任务是方案的核心部分，包括标准发布，集成各个部件，中央控制和协调，数据分析，专家系统，人机交互等。涉及到标准制定、软件开发、网络构架、数据库设计、信息发布等技术层面工作；同时也必须与各子课题承担单位进行协调和沟通，确保功能定义、接口标准的一致性。这个协调沟通过程从设计阶段就开始，覆盖整个开发过程，一直到后期的联调和集成；最后本任务也是高通量筛选过程逻辑与分析理论的最终体现，用户可定义并实施特定的筛选过程和分析方法。本任务是高通量筛选系统的总成环节，是课题成果的集中体现。